吉林省肝胆病医院药剂科是集药品供应、药事管理、合理用药及监督执行药政法律法规为一体的专业技术职能科室。目前有药师33人。其中正高级职称1人，副高级职称6人，中级职称8人，初级职称10人，临床药师4人。

设有药剂科办公室、住院药房、门急诊药房、中草药房、中西药库、输液库、临床药学室、药学门诊、GCP药房、煎药室等。全面负责医院药品的采购、存储、发放、合理用药、日常质量管理、药事法律法规培训、药品政策落实、药学数据监测、上报、用药咨询、药学科普等工作。

中草药房现有中药饮片、中药颗粒剂两种剂型，可制作中药膏方、中药汤剂。

拥有院内中药制剂备案品种7个：抗肝纤丸（大蜜丸）、疏肝解毒丸（水蜜丸）、麻仁通便丸（水蜜丸）、疏肝和胃丸（水蜜丸）、茵陈利胆丸（水蜜丸）、利胆退黄丸（水蜜丸）、杞参养肝丸（水蜜丸）。

院内制剂在质量方面严格把控。筛选道地中药材作为制剂原材料，配合现代化的工艺流程制备，严格按照标准进行检验。经过多年临床使用验证，疗效确切、安全有效。属于经典肝胆病治疗用药。能够替代部分西药和中成药的治疗。在治疗肝胆等消化系统疾病方面有显著优势，获得广大患者普遍认可。